BAC hybridization for MBO2, ACE2808 and MBB1 probes, linkage group IX

This table contains molecular mapping data from the Silflow-Lefebvre laboratory at the University of Minnesota.
The contigs consist of BamHI/HindIII fragments. Initially these were unordered, but in some cases we have been able to order them based on the genomic sequence. The highlighted BAC fragments below are ordered based on sequence of v2.0 scaffold 166 or 71.

scaffold 166   scaffold 71
                      ACE2808           MBO2                 MBB1          
Frag.sizes(kb) 6.2 1.5 6.3 3.0 10.5 3.2 3.2 3.0 1.7 3.6 4.5 10.5 16 5.9 2.4 8.9 7.0 2.0 7.3 6.2 5.4 6.6 3.0 10.5 3.1 16 2.5 21.3 3.0 6.6 3.8 3.4 11.5 5.0
BACs                                                                    
10n4                     x x x x x x x x x x x x x x x x                
12j17                         x x x x x x x x x x x x x                  
18m16                                     x x x                        
19o14                                       x x x x x x x x x x x x x x  
25i8                                 x x x x                            
27k12       x x x x x x x x x x x x x x x x x x                          
3n4                                       x x x x x                    
36k18           x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x              
6i7                                     x x x x x x x                  
31k7                                       x x x x x x x                
12d22           x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x x              
5o11                                 x x x x x x x x x x                
2n14           x x x x x x x x x x x x x                                
2a18 x x x x x x x x x x x x x x x x x x                                
34f1 x x x x x x x x x x x x x                                          
4c12 x x x x x x x x x x x x x x x x                                    
16p16 x x x x x x x x x x x x x x x x x x                                
23g18                       x x x x x                                    
18o8       x x x x x x x x x x x x x                                    
10a21                                                     x x x x x x    
14a10                                                   x x x x x x x x  
20d8                                           x x x x x x x x x x      
21b24                                                     x x x x x x    
21 e23                                               x x x x x x x x x x x
28a18                                               x x x x x x x x x    
39i12                                                   x x x x x x      
4 e10                                                     x x x x x      
 

215 kb contig


Last updated on October 7, 2004
by Nancy Haas nancy-h@cbs.umn.edu

Back to Linkage Group IX table